Contribución del uso de XPERT MTB/RIF y su costo-efectividad en el diagnóstico de tuberculosis pulmonar y la resistencia a rifampicina: una comparación con métodos diagnósticos no moleculares / Contribution of the use of xpert MTB/RIF and its cost-effectiveness in the diagnosis of pulmonary tuberculosis and resistance to rifampicin: a comparison with non molecular diagnostic methods

Resumen Introducción: La tuberculosis es un problema de salud pública; su control requiere diagnóstico temprano y tratamiento oportuno. Xpert MTB/RIF® es una tecno logía diagnóstica basada en PCR en tiempo real, detecta el Complejo Mycobacterium tuberculosis y la susceptibilidad a rifampicina. Objetivo: Determinar la contribución del Xpert MTB/RIF y su costo-efectividad en la detección de tuberculosis y la resistencia a rifampicina en muestras respirato rias al compararlo con métodos de diagnóstico no moleculares Materiales y Métodos: Se analizaron 1.574 muestras de pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar que fueron procesadas para microscopía con coloración fluorescente de auramina-rodamina, Xpert MTB/RIF y cultivo en BACTEC MGIT 960. Los resultados obtenidos se compararon entre los métodos no moleculares y los moleculares para la detección de M. tuberculosis y susceptibilidad a rifampicina y se realizó un análisis comparativo de costos y costo efectividad. Resultados: 19,2% de las muestras fueron positivas por alguna de las técnicas usadas. Xpert MTB/RIF detectó M. tuberculosis en 90,4% del total de muestras positivas con un índice Kappa de 0,77 (IC95%: 0,74-0,82) comparado con el cultivo. La resistencia a rifampicina por Xpert fue 8,1%, sensibilidad 94,1% (IC95%: 73,0-99,0%), especificidad 98,4% (IC95%: 95,5-99,5%) y Kappa de 0,88 (IC95%: 0,76-1,00). La razón incremental de costo efectividad (RICE) fue menor en Xpert MTB/RIF comparada con el cultivo. Conclusión: Xpert MTB/RIF es una prueba eficiente y costo efectiva en la detección de casos de M. tuberculosis en muestras pulmonares comparado con los mé todos de diagnóstico basados en cultivo, sin embargo y a diferencia del Xpert MTB/RIF, estos pueden aportar en el diagnóstico con el aislamiento de especies de micobacterias no tuberculosas y la susceptibilidad a isoniazida y otros medicamentos.

Abstract Introduction: Tuberculosis is a public health problem its control requires early diagnosis and timely treatment. Xpert MTB/RIF is a real-time PCR based diagnostic technology, detects the Mycobacterium tuberculosis complex and rifampicin resistance. Objective: To determine the contribution of Xpert MTB/RIF and its cost-effectiveness in the detection of potential positive cases for tuberculosis and resistance to rifampicin in respiratory samples comparatively with diagnostic non molecular methods Materials and Methods: From 2013 to 2015, 1.574 clinical samples of patients with suspected pulmonary tuberculosis were evaluated by smear microscopy using auramina-rodamina stain, Xpert and culture in liquid medium BACTEC MGIT 960®. Results: 19,2% of the samples were positive for any of the methods used, Xpert detected M. tuberculosis in 90,4% of the positive samples and the concordance between Xpert and cultures had a Kappa index of 0,71 (IC95%: 0,62-0,72). Xpert identified resistance to rifampicin in 8,1% of the clinical samples studied with a sensitivity 94.1% (IC95%: 73,0-99,0%), specificity 98,4% (IC95%: 95,5-99,5%) and Kappa index 0,88 (IC95%: 0,76-1,00). Xpert had an incremental cost effectiveness ratio lower than culture (RICE). Conclusion: Xpert MTB/Rif is efficient diagnostic technique and comparable with culture in cost effectiveness for pulmonary tuberculosis diagnosis. However, culture based methods, in contrast to Xpert, may allow the isolation and identification of non tuberculosis mycobacterial species and the possibility to perform susceptibility for other antituberculous drugs.

Adverse treatment outcomes in multidrug resistant tuberculosis go beyond the microbe-drug interaction: Results of a multiple correspondence analysis / Los resultados adversos en el tratamiento de la tuberculosis resistente a múltiples fármacos sobrepasan la relación fármaco-microorganismo: resultados de un análisis de correspondencia múltiple

Abstract . Introduction: Multidrug-resistant tuberculosis treatment is effective in 50% of patients due to several factors including antibiotic susceptibility of the microorganism, adverse treatment reactions, social factors, and associated comorbidities. Objectives: In this study, we describe the demographics, clinical characteristics, and factors associated with treatment outcomes in multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) patients in Medellín, Colombia. Materials and methods: We conducted a retrospective analysis using data from patients diagnosed with MDR-TB attending Hospital La María in Medellín, Colombia, for treatment between 2010 and 2015. Patients were categorized as having successful (cured) or poor (failure, lost to follow-up, and death) treatment outcomes. Associations between demographic, clinical factors, laboratory results, treatment outcomes, and follow-up information were evaluated by univariate, multivariate, and multiple correspondence analyses. Results: Of the 128 patients with MDR-TB, 77 (60%) had successful outcomes. Of those with poor outcomes, 26 were lost to follow-up, 15 died, and 10 were treatment failures. Irregular treatment, the presence of comorbidities, and positive cultures after more than two months of treatment were associated with poor outcomes compared to successful ones (p<0.05 for all). The multiple correspondence analyses grouped patients who were lost to follow-up, had HIV, and drug addiction, as well as patients with treatment failure, irregular treatment, and chronic obstructive pulmonary disease. Conclusion: The recognition of factors affecting treatment is essential and was associated with treatment outcomes in this series of patients. Early identification of these factors should increase the rates of treatment success and contribute to MDR-TB control.

Resumen . Introducción. El tratamiento de la tuberculosis multirresistente tiene una efectividad del 50 %, afectado por múltiples factores como la sensibilidad del microorganismo, las reacciones secundarias, los factores sociales y las comorbilidades existentes. Objetivos. Describir la demografía, las características clínicas y los factores pronósticos asociados con los resultados del tratamiento en pacientes multirresistentes (TB-MDR) de Medellín, Colombia. Métodos. Se hizo un análisis retrospectivo de los datos de los pacientes con TB-MDR atendidos en el Hospital La María de Medellín, Colombia, que fueron tratados entre el 2010 y el 2015. Los pacientes se categorizaron con tratamiento exitoso (curados) o con tratamiento fallido (falla en el tratamiento, pérdida durante el seguimiento y muerte). Se determinó la asociación entre las características demográficas y clínicas, los resultados de los exámenes de laboratorio, los desenlaces del tratamiento y la información del seguimiento, utilizando análisis univariado, multivariado y de correspondencia múltiple. Resultados. De 128 pacientes con TB-MDR, 77 (60 %) tuvieron un tratamiento exitoso. De los que tuvieron un tratamiento fallido, 26 pacientes se perdieron en el seguimiento, 15 murieron y 10 tuvieron falla en el tratamiento. El tratamiento irregular, las comorbilidades y los cultivos positivos más allá de 2 meses de tratamiento se asociaron significativamente con los tratamientos fallidos (p<0,05). El análisis de correspondencia múltiple agrupó los pacientes con pérdida en el seguimiento, con HIV y tratamientos irregulares, y los pacientes con tratamientos irregulares y enfermedad pulmonar obstructiva crónica con falla en el tratamiento y muerte. Conclusión. El reconocimiento temprano de los factores que afectan el desenlace del tratamiento de los pacientes con TB-MDR es esencial; la identificación de dichos factores debería incrementar el éxito del tratamiento y contribuir al adecuado control de la TB-MDR.

Evaluation of Simple and Cost-Effective DNA Preparation and Subsequent PCR Amplification for Clinically Relevant Mycobacteria.

Aim: Slow growth rate in culture renders the traditional isolation, identification, and drug susceptibility testing of clinically important mycobacteria inadequate when there is an urgent need for a precise diagnosis in order to initiate patient treatment. Molecular methods all rely on mycobacterial DNA isolation which in turn has become an essential step of the process. Our study aimed to evaluate DNA isolation protocols from mycobacteria of clinical interest. Methods: Therefore, in order to determine an optimal method we evaluated 8 inexpensive, rapid and easy DNA isolation methods from 30 mycobacterial cultures (10 Mycobacterium tuberculosis and 20 Non-tuberculous Mycobacteria) for subsequent direct detection by PCR. Results: Six of those 8 methods reliably allow the isolation of good DNA yields and quality, the optimal protocol being the one that includes a 1% Triton X-100 lysis solution. Protocols using SDS 1% as a lysis solution did not yield DNA suitable for PCR amplification. Conclusion: Six of the methods we evaluated can easily be implemented in resource limited settings for routine use, potentially contributing to a better management of mycobacterial infections.

Infección nosocomial por enterococo resistente a la vancomicina: características clínico-epidemiológicas y factores de riesgo / Nosocomial infection by Vancomicin resistant Enterococcus: Clinical - epidemiological characteristics and risk factors

Objetivo: caracterizar clínica y epidemiológicamente, y establecer los factores de riesgo de un brote de infección nosocomial por Enterococcus faecium resistente a vancomicina en el HUSVP de Medellín. Metodología: se realizó un estudio con una fase descriptiva (27 casos) y un diseño tipo casos (27) y controles (54). Resultados: los 27 casos de E. faecium tuvieron un alto nivel de resistencia a vancomicina (128 ug/ml), y además fueron resitentes a teicoplanina, ampicilina, penicilina, ciprofloxacina, y gentamicina y estreptomicina de alto nivel. En el 67 por ciento de los casos se interpretó cono infección; el 33 por ciento de las cepas se aislaron de orina y el 22 por ciento de cavidad abdominal. Los factores de riesgo asociados fueron la insuficiencia renal (RD 12.6), nutrición parenteral total (RD 6.2), la cirugía abdominal (RD 4.1), uso previo de metronidazol (RD 19.5) ceftazidima (RD 15.9), cefotaxima (RD 12.6), imipenem (RD 11.6), ciproflaxina (RD 6.7), vancomicina (RD 5.4), ampicilina/sulbactam (RD 4.4), días estancia (p=0.004), días entre el ingreso y la infección (p=0.0007), número de cirugias (p=0.0004) y número de antibióticos previos (p=0.00005). Conclusiones: esta es la primera epidemia de ERV que se publica en Colombia, con un análisis clínico, epidemiológico y de factores de riesgo, y nos muestra una realidad ya vivida por otros países y de muy difícil manejo, y nos alerta sobre la posibilidad de aparición de Staphylococcus aureus con sensibilidad disminuida a la vancomicina

Actividad in vitro de quinupristin / Dalfopristin (Synercid) / In vitro activity of Quinnnupristin / dalfopristin (synercid)

Introducción: Las infecciones por bacterias Gram-positivas multirresistentes han aumentado en los últimos años en Colombia y en el mundo. Quinupristin / Dalfopristin (Q/D, Synercid), un antibiótico de la familia de las estreptograminas, ha demostrado una potenta actividad in vitro e in vivo contra estos gérmenes. Objetivos: determinar en nuestro medio kla actividad in vitro de Q/D en aislamientos hospitalarios de cocos Gram-positivos y Haemophilus influenzae, y compararla con la de otros antibióticos usados en estas circunstancias. Diseño: estudio de sensibilidad in vitro por Concentración Inhibitoria Miníma (CIM) a través del método de microdilución en caldo. Lugar: Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB). Población del Estudio: cien aislamientos hospitalarios, distribuídos así: Staphylococcus aureus resistente a meticilina -SARM -(n=25), estafilococo coagulasa - negativa resistente a meticilina -ECNRM - (n=25) Enterococcus spp (n=20). Resultados: Q/D se mostró altamente eficaz en los aislamientos de SARM (S = 100 por ciento), S. pneumoniae (S 0 100 por ciento), S. viridans (CIM subíndice 90 = 0.25 amstrong /mL) y H influenzae (CIM subíndice 90) = 1.0 amstrong /mL) Su actividad frente a ECNRM fue aceptable (S = 72 por ciento) y mala contra E. faecalis (S = 0 por ciento). Vancomicina, rifampicina y ceftriaxona tuvieron 100 por ciento de actividad en las especies en las cuales se probaron. Conclusiones: Q/D (Synercid) fue efectivo in vitro contra la mayoría de los cocos Gram-positivos de origen hospitalario, excepto E. faecalis. es pues una buena alternativa en infecciones producidas por estos gérmenes, especialmente si son multirresistentes, y cuando se presentan reacciones adversas a otros fármacos.

Identificación de Mycobacteium tuberculosis mediante el análisis del perfil de ácidos micólicos por cromatografía líquida de alta presión (HPLC) / Identification of Mycobacterium tuberculosis through the analysis profile of mycolics acids by high-pressure liquid chromatography (HPLC)

Con el fin de validar una técnica de cromatografía líquida de alta presión (HPLC) para la identificación de Mycobacterium tuberculosis, se evaluaron 164 aislamientos de Mycobacterium spp. entre octubre de 1994 y octubre de 1995 en la Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB). Todas las cepas provenían de pacientes y pertenecían a la colección de cepas del Laboratorio de Bacteriología de la CIB y fueron identificadas tanto por las pruebas bioquímicas tradicionales como por HPLC: Las pruebas bioquímicas se consideraron como el estándar de oro. Según éstas, 80 cepas fueron identificadas como M. tuberculosis y 84 como diferentes a M. tuberculosis. Dos cepas de M.Tuberculosis fueron identificadas en forma incorrecta por HPLC, una de ellas fue identificada como M. bovis-BCG y la otra como M. intracellulare. La sensibilidad de HPLC para la identificación de M. tuberculosis fue de 97,5 por ciento, la especificidad fue de 100 por ciento, el valor predictivo positivo de la prueba de 100 por ciento y el valor predictivo negativo de 97,7 por ciento

Claritromicina en amigdalofaringitis aguda estreptocóccica / Clarithromycin in acute streptococcal tonsillopharyngitis

El presente estudio tuvo como objetivo estudiar la eficacia y seguridad de la claritromicina en pacientes de 10 o más años de edad con diagnóstico de amigdalofaringitis aguda estreptocóccica. De 188 pacientes estudiados, 43 (22.8%) tuvieron la prueba rápida (Test Pack Strep A) y el cultivo positivo para Streptococcus pyogenes; 40 fueron tratados con claritromicina a una dosis de 250 mgs/12 horas/10 días. Todas las cepas de S. pyogenes identificadas resultaron ser sensibles In vitro a este nuevo macrólido. En la evaluación clínica, 5-7 días post-tratamiento, 39 (97%) estaban clínicamente curados y el restante presentó mejoría. La evaluación bacteriológica demostró erradicación de la bacteria en 37 (92.5%) y persistencia o recaída en los 3 restantes. Se presentaron pocos efectos adversos y ninguno de ellos obligó a suspender el tratamiento. La claritromicina resultó ser efectiva y bien tolerada en el tratamiento de la amigdalofaringitis aguda estreptocóccica.

Un brote por Mycobacterium chelonae, subespecie abscessus asociado a hiposensibilización en pacientes alérgicos

Se estudiaron trece pacientes sometidos a hiposensibilización, quienes presentaron abcesos subcutáneos después de la inyección aeroalergenos (A.E.A). El examen microbiológico del material obtenido permitió identificar Mycobacterium chelonae subespecies abscessus, en 11 de ellos: A estas cepas se le practicaron pruebas de sensibilidad a diferentes drogas. La evolución de los pacientes dependió del tamaño, tipo y número de lesiones, además del tipo de tratamiento empleado. No se presentaron manifestaciones sistémicas en ningún paciente. M. chelonae puede ser introducido iatrogénicamente a las personas que se someten a cualquier tipo de procedimiento invasivo.